光伏发电防孤岛保护装置在变电站中的主要作用就是产生故障时断开并网点开关，避免线路上有人员施工检修造成不必要的人员 伤亡，避免电网故障而引起光伏电站的不正常运行，对电站造成冲击。
当故障发生时必须快速准确地切除并网开关。变电站中有比较齐全的微机保护装置，当故障发生时， 对应的微机保护就会及时准确地动作。孤岛保护装置有时候在电站中作为一个后备保护存在。而对于分布式光伏电站来讲，由于安装容量比较小，而且低压并网，因此一般没有建变电所。正是由于这个原因，为了保证电网的安全，根据当地要求，一般会有防孤岛保护装置、同期装置、电能质量监测装置等。
光伏发电防孤岛装置的保护配置功能如下：
（1）低频保护：频率在35～65Hz之间，且在低频值以上时，低频保护才能启动，低频保护动作200 ms后立即返回。
（2）过频保护：当频率高于定值时，保护启动。
（3）低压保护：当电压低于定值时动作。
（4）过压保护：当电压高于定值时动作。
（5）联跳：支持变电站侧联跳，即当收到变电站侧联跳命令时延时开关跳闸，切本站的并网开关
（6）频率突变：当频率波动值超过所设定值时，保护动作。
